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La piattaforma NBFC potenzia le capacità con un servizio HPC avanzato per l'elaborazione interattiva

Il nuovo servizio InterActive Computing (IAC), in produzione sul supercomputer Galileo100 di CINECA, è ora disponibile per la comunità NBFC, offrendo un modo completamente nuovo di accedere alle risorse di supercalcolo con una capacità di oltre 2 Pflop e oltre 20 PB di archiviazione dati.

Il servizio IAC è fornito da CINECA Consorzio Interuniversitario, il Centro nazionale italiano di calcolo ad alte prestazioni che supporta le attività di ricerca della comunità scientifica accademica e offre servizi di elaborazione alle università in Italia e in Europa da oltre 50 anni, partner del National Biodiversity Future Center (NBFC).

IAC è un approccio alternativo all'accesso tradizionale alle risorse HPC (ad esempio, tramite batch job) in quanto fornisce un accesso quasi immediato ai nodi computazionali tramite un'interfaccia con web browser.

Il servizio IAC fa parte della piattaforma digitale NBFC che mira a (a) riorganizzare, digitalizzare e armonizzare i dataset nazionali esistenti per renderli accessibili e utili a un vasto pubblico, (b) fornire servizi di monitoraggio, conservazione e pianificazione della biodiversità a vari tipi di utenti come ricercatori e decisori, (c) ospitare un catalogo di modelli/strumenti e fornire un accesso semplificato a dataset complessi come i dati climatici ospitati da Copernicus e (d) supportare il monitoraggio della biodiversità e l'integrità ecologica su scala nazionale con un monitoraggio in tempo reale (mirando a un sistema di allerta precoce) a una risoluzione di 2 km o superiore. La piattaforma digitale NBFC colma il divario tra le esigenze della comunità scientifica NBFC e la disponibilità di modelli di dati e potenza di calcolo.

CINECA è stata in grado di fornire ai data scientist di NBFC un modulo specifico, creato per il mondo HPC, che consente loro di ottimizzare le proprie attività in termini di semplicità, funzionalità ed efficacia, sfruttando una modalità di accesso cloud all'architettura HPC di CINECA. Il servizio IAC consente a ciascun utente di creare un ambiente di lavoro che si adatti al meglio alle proprie esigenze di ricerca, combinando strumenti di analisi dei dati, visualizzazione, creazione di flussi di lavoro e altre funzioni implementate nel nuovo servizio di elaborazione interattiva. Una volta effettuato l'accesso con il sistema di autenticazione a due fattori, per aumentare il livello di sicurezza, le risorse saranno accessibili quasi immediatamente, eliminando i tempi di attesa solitamente richiesti per avviare una sessione di elaborazione interattiva.

Il servizio offre un accesso web alle risorse di calcolo, introducendo al contempo la tecnologia Jupyter nell'ambiente HPC, che consente la creazione di notebook interattivi e permette agli utenti di esplorare i dati, eseguire simulazioni e visualizzare i risultati in tempo reale. Inoltre, il nuovo ambiente interattivo si integra direttamente con il sistema di gestione delle risorse attualmente in produzione presso CINECA (il pianificatore SLURM), consentendo una gestione efficiente di tutte le richieste inviate agli ambienti di supercalcolo. È di fatto un servizio progettato per migliorare l'esperienza dell'utente, sia per gli utenti interattivi che per quelli che preferiscono usare la linea di comando, dando priorità alla facilità d'uso e all'efficienza.

La Piattaforma Digitale NBFC:

Il servizio IAC è parte della Piattaforma Digitale NBFC e comprende quattro principali aree tematiche:

  1. Digitalizzazione delle Collezioni di Storia Naturale,

  2. Biodiversità molecolare,

  3. Biomolecole, biosorgenti, bioattività,

  4. Biodiversità e Funzione degli Ecosistemi (BEF).

Le quattro Aree Tematiche, ciascuna delle quali affronta una dimensione fondamentale della biodiversità, hanno diversi componenti in comune, e gli output di un'Area Tematica sono spesso utilizzabili come input per l'altra Area Tematica. Nella figura seguente è descritta schematicamente l'architettura della Piattaforma. L'area IAC mira a supportare utenti avanzati nell'analisi dei dati o nella creazione di pipeline che possono essere rese disponibili agli utenti della Piattaforma.

Cineca

Come richiedere l’accesso:

Per ottenere l'accesso alle risorse computazionali fornite dal progetto AIC per il NBFC, l'utente deve prima registrarsi su UserDB di CINECA, compilando il modulo con le informazioni richieste. Successivamente, l'utente deve essere associato al progetto dal Principal Investigator (Prof. Andrea Galimberti, University of Milano-Bicocca, e-mail: andrea.galimberti@unimib.it). Sono necessari circa 1-2 giorni per elaborare i dati forniti con la registrazione. Infine, l'utente può accedere alla pagina di login e utilizzare le proprie credenziali per accedere alle risorse computazionali.

Per ulteriori informazioni o assistenza, si prega di inviare una e-mail a: nbfc.info@cineca.it.

Continuate a seguirci, nelle prossime settimane il team di CINECA organizzerà sessioni dedicate per introdurre i ricercatori del centro NBFC all'uso dell'IAC!

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